未到西屿之前，李彦直面对澎湖如临大敌，到了这里才现情况根本不是自己想的那样，心态也就放轻松了许多。
西屿既定，李彦直且派卢复礼与杨舟去勘定地形，寻着一处良港，另将船队拉过去停泊，又在港边6地上安营扎寨，然后才派王牧民、吴平轮流出巡，以西屿渔民为向导，若遇渔民则招抚来降。若遇倭寇则痛击之。
这澎湖列岛共有大大小小九座寨子，基本上都以耕、渔为主业，偶尔也出去打劫，但那只是副业。在吴平、王牧民的威慑下，九寨中有八个先后表示臣服，只有龙门港的蔡大路不肯来附。蔡大路所在的寨子是澎湖诸寨之，势力最大，控制着澎湖本岛上数百多户居民，那八个已经臣服的寨主里见蔡大路不服，便有四家反复起来，各闭寨门抗拒李彦直。
李彦直正要设法抚略他们，以便搜索倭寇，但他指令未下，王牧民那边却已经闯到龙门港开炮了！李彦直本来想用柔和一点的办法，但炮都开了，总不能收回来，便命吴平前往增援。
澎湖列岛地偏民穷，龙门港水寨不过集中了澎湖岛的那点物资，虽也建了点寨墙，但论到装备却如何能与机兵团的船队相比？王牧民和吴平前后驱使六艘大帆船冲了过来，龙门港水寨的水手望见，哪里还敢驾船出来？
蔡大路呼喝着指挥寨中死守寨门，王牧民见水寨寨墙是用土夯成，厚度约有二尺，或挡得住炮火，便不浪费弹药，命下属将炮口调高，直接将炮弹轰进寨中杀人，寨中盗众听到炮响，身受炮轰，个个惊骇鼠窜，龙门港水寨登时乱成一窝蚂蚁。
吴平率领一百二十名悍卒驾驶十艘小船冲近，这时水寨内乱哄哄的，蔡大路都收束不了手下，只有部分人还冒着炮火死守寨门，北段的寨墙上一时无人防备，二十名机兵冲到寨墙边上，向上抛起带钩绳索，那寨墙不过九尺余，连续喀拉声响，寨墙上已挂上了二十支钩子，二十名近战兵试试已经钩稳便抢攀上去，上墙后左手持藤牌，右手按腰刀，蹲伏于墙上。寨内盗众望见时，这一段寨墙已被占据。
在二十名近战兵之后，又有二十名弓箭手攀附而上，近战兵保护着寨墙上的这片阵地，二十名弓箭手上来后即四向矢，把要冲上来的盗众射杀下去。他们才射得两三箭，第三拨人马——二十名鸟铳手已攀了上来。他们上来之后，墙上便显得挤了，二十名近战兵渐渐向两边逼去开拓新的阵地。
龙门港寨内的盗众这时已渐渐习惯王牧民火炮的轰炸，慢慢收敛了惊慌，蔡大路也组织起来一支约四十多人的队伍要向墙头反击，却听砰砰砰鸟铳乱响，若说王牧民的大炮只是算准了人多处乱轰，那这鸟铳便是一对一地准瞄！枪弹伴随着箭雨，只了一轮，寨内刚刚稳住的局面又乱了起来！
这时吴平所率领的四十名健卒已经上墙，但他们却不像前面三拨人马，上墙后就在墙上守卫或攻击，而是一攀上就直接跳入寨内！这四十名健卒中有十五名双手刀兵，十五名长枪兵，以及十名近战兵，他们跳进了寨墙内侧的同时，先前上墙的二十名近战兵也跳下汇合，鸟铳手继续攻击，弓箭手则箭掩护同袍。吴平利用这个空挡稍微调整了墙内六十人的队列，随即便分成三列冲了过去。长枪开路，白刃耀空，箭从天空飞下，刀自近处袭来，在这帮人面前，龙门港的盗众如何能正面抵挡？只稍微抵挡便节节败退！
吴平所带的最后二十名船工这时也攀上了墙跳入墙内，夺了寨内小船径到水门处开了水闸，门外王牧民的手下可等了好久了！一见门开数百人一起涌了进来。蔡大路望见，便知道这番是输了个彻底，看看跟了自己多年的弟兄都在大刀长枪之下战栗待死，长长叹了一口气，抛下手中的大刀，冲了出来叫道：“别打了，别打了！我们投降了。”
几个心腹惊叫道：“寨主，不可以啊！”
早有几名双手刀客挥刀而前，长枪手拦敌于外，蔡大路的十几个见寨主就要落入敌手，拼着一死也要抢上来救他回去，却被蔡大路喝道：“住手！住手！统统住手！”
盗众才静了下来，蔡大路双手一伸，道：“来吧，绑了我去见你们的狗官！不要为难我的兄弟了！”
吴平拇指一竖，道：“好汉子！放心，只要你们不乱来，我不会怎么着你们！”命人将他看住，又下令众盗缴械，众盗起先不肯，但看看寨门已破，领也已经束手就擒，便都失去了斗志。吴平缴了群盗器械，王牧民拆了水寨大门，然后便将蔡大路和十几个头目押了来西屿见李彦直。
李彦直这时已经将大本营移到澎湖岛北部的妈祖庙旁，此战进行期间，不断有小船来回于龙门港与妈祖庙之间，向李彦直汇报战况，所以吴平等未回，李彦直已经对战况了如指掌。
蔡大路押到时，他正在给妈祖上香，蔡大路见了心道：“这狗官还知道敬妈祖，看来坏得还不彻底。”
李彦直上完了香在妈祖庙旁坐下，扫了蔡大路一眼，方问：“我奉都指挥使令谕，募机兵出海，巡诸岛，击倭寇，来到澎湖，你为何抗拒于我！”其实所谓“奉都指挥使令谕”这种话，他在大6时是不敢说的，因为孙泰和不过给了他个口头承诺，哪有给他什么令谕？但到了海上，尤其是这些草根盗众，谁知道其中底细？李彦直拿着鸡毛当令箭，以举人身份说出这句话来，便俨然有代表官方